צה"ל אישר כי מבחינה ביטחונית ניתן להשיב לפעילות את קו הרכבת אשקלון-שדרות. החל מ-1 בפברואר יאפשר הצבא, בתיאום עם רכבת ישראל, את פעילות הקו.
לפי צה"ל, במסגרת ההכנות לפתיחת הרכבת שולבו יכולות טכנולוגיות ומיגון לחיזוק ההגנה, זאת בנוסף ליכולות איסוף ופעילויות מבצעיות הכרחיות מותאמות, על מנת ליצור שכבת הגנה ואמצעי מיגון. עוד נמסר כי משרד התחבורה ורכבת ישראל ערוכים לחידוש התנועה, ויפרסמו את לוח זמני הרכבות בימים הקרובים באמצעי התקשורת, באתר האינטרנט של הרכבת או ביישומון.
"צה"ל רואה ברכבת תשתית לאומית אסטרטגית חשובה למדינת ישראל, וגורם מרכזי בהליך שיקום הנגב המערבי", נמסר מדובר צה"ל, "על כן הושקעו כלל המאמצים בכדי לאפשר את חזרתה בצורה המיטבית והבטוחה ביותר".
מתנועת "עתיד לעוטף", שהובילה את המאבק לפתיחת קו הרכבת, בירכו על ההודעה ומסרו: "יש עוד הרבה עבודה לפנינו - בראש ובראשונה, עלינו לוודא שמפסיקים למגן אותנו כתחליף לביטחון ושאיום הטרור על הרכבת נגדע מהשורש. לא נסכים לחזור לאשליית 6 באוקטובר, בה חיינו בקונספציה שמיגון זה ביטחון. בנוסף לזאת, יש להבטיח שהנסיעות יהיו תכופות ורצופות, כולל בערבים המאוחרים ובימי שישי ומוצ"ש, מה שיאפשר שגרת חיים נורמלית בעוטף". בתנועה הדגישו כי הרכבת "חוזרת לפעול מוקדם מהתכנון המקורי, שכלל מיגון ב-800 מיליון שקלים ואת סגירת הרכבת למשך 5 שנים".
ביוני כתב השר סמוטריץ' לראש הממשלה נתניהו כי הוא "מתנגד בכל תוקף להשקעה כזאת משמעותית בהגנה על קו הרכבת, וזאת מאחר שמשמעותה האמיתית של השקעה כזאת הינה הפסד במלחמה". לפי השר, "המסר של ביצוע מיגון כזה הוא הרסני כלפי חיילינו בזמן מלחמה, הרסני כלפי יכולת ההרתעה שלנו והנחישות שאנו משדרים מול האויב להשמידו, ולא פחות חשוב מכך משדר מסר משפיל כלפי תושבי הדרום, שממשלת ישראל אינה מסוגלת להגן עליהם". עם זאת, לא כל תושבי האזור הצטרפו לתחושותיו של השר ויצאו נגד פתיחתו של הקו ללא מיגון.
כידוע, מאז תחילת המלחמה נסגר קו אשקלון-שדרות. בימים אלה, וככל הנראה עד שתחודש פעילות הקו, הנסיעה מתחנת שדרות מתאפשרת לכיוון דרום בלבד (נתיבות, אופקים ובאר שבע). נוסעים שיעדם צפונה נדרשים לבצע החלפת רכבות בתחנות ב"ש ולהמשיך ליעדם.