בעוד הממשלה מתגאה בתקציב של 100 מליון שקלים לנגב, יש מי שזועמים על ההחלטה שמדירה את המרחב הכפרי. ראשי מועצות מהנגב טוענים להתעלמות בוטה מאזור שמהווה כמחצית מהמדינה ואינו נכלל בהחלטה.
ערן דורון - ראש מ.א רמת הנגב, מאיר צור - ראש מ.א ערבה תיכונה ודר' חנן גינת - ראש מועצת חבל אילות, פנו במכתב משותף לראש הממשלה והדגישו כי זוהי "התעלמות מוחלטת ושוב ממשלתך לא מכירה ולא רואה את ההתיישבות על הגבולות כערך לאומי אותו צריך לחזק".
עוד ציינו כי המועצות מתמודדות יום-יום עם אתגרים כבדים, כולל ריחוק ממרכזי אוכלוסייה ושירותים, בעיות ביטחון, תשתיות, מים, חינוך ותעסוקה, המקשים מאוד על ההתיישבות החלוצית באזורים הנרחבים האלה. המרחב הכפרי שומר על הגבולות, פועל לייצור מזון ואנרגיה לכלל עם ישראל ושותף מהמסד ועד הטפחות בפיתוח הנגב.
ראשי המועצות הודיעו כי החלטה חסרה זו פוגעת קשה בפיתוח הנגב המזרחי, והם אינם מתכוונים שתושביהם יופלו שוב ושוב. המועצות קוראות לראש הממשלה ולממשלה לשלב באופן מידי את המועצות האזוריות בהחלטה המתוקצבת, ומבהירים: "נפעל לעצור את ההחלטה אם המועצות האזוריות לא ישולבו בה".