פעמיים בשנה השקנאים נודדים מאירופה לאפריקה וחזרה, בדרכם הם עוצרים במקורות מים מתוקים בישראל על מנת לנוח ולצבור אנרגיה להמשך הדרך. באביב, עונת הנדידה של השקנאי המצוי מתחילה במרץ והיא תסתיים בחודש מאי.
להקת השקנאים במדבריום היא להקה של שקנאים מצויים פצועים שלא יכולים לחזור לטבע והיא מונה חמישה פרטים, מתוכם תוכלו לפגוש כבר בכניסה למתחם את החבורה העליזה של ביבי, בוז'י ובוגי. השלושה נמצאים במתחם נווה המדבר, בסמוך לאגם של ההיפופוטמים צ'יפופו ושמוליק להם הם מארחים חברה.
איך הם הגיעו למדבריום? בשנת 1992 השקנאים ביבי ובוז'י עצרו לנוח בבריכה מלאכותית לגידול דגי מאכל, אך לצערנו הרב חקלאי ירה בהם כי חשב שהם מזיקים לחקלאות. השקנאים אינם יודעים להבדיל בין בריכת דגים טבעית למלאכותית, מה שמגביר את הסיכון עבורם. כתוצאה מהירי ביבי איבד את כנף שמאל ובוז'י איבד את כנף ימין ובשנת 2007 בוגי השקנאי נפגע ברגליים. שני שקנאים נוספים הגיעו מבית החולים לחיות בר בספארי, לאחר שנפצעו בכנפיהם. להקת השקנאים במדבריום ניצלה, אך הם אינם יכולים לשוב לטבע ולשמחתנו קיבלו הזדמנות שניה וחיים יחד בנווה המדבר במדבריום.